续作中的指挥官和上校误以为太阳帝国开发出了一种具有大规模杀伤力的超级武器,于是决定先发制人,对太阳帝国所在的珊瑚礁岛屿发起了突然袭击,世界再次陷入了战争的危机之中。玩家可以在游戏中操纵坦克、指挥军舰、驾驶战斗机,并指挥自己的军队直捣敌军大本营,在Wii上完美再现这款人气战略游戏的风采。
在《突击!!超级大战争VS》中玩家将化身为小队司令官操纵飞弹兵、火箭兵、战车、战斗机、潜水艇、战舰等20种以上各式各样的部队单位来进行战斗,并引导我方部队获得胜利的一款动作游戏。而除了玩家直接操纵的部队之外,玩家还可以对其他的战斗单位下达指令,完成从敌国攻击中守护母国等等的众多任务关卡。